Музей начал свое существование, как частная тератологическая (Тератология - наука, изучающая врождённые уродства отдельных органов и целых организмов в растительных и животных царствах) коллекция Герардаса Вролика (1755-1859) и его сына Вильяма Вролика (1801-1863). Оба были профессорами анатомии в университете Athenaeum Illustre, предшественнике Амстердамского университета.
Собирательство и изучение разнообразных мутация была любимая тема натуралистов в 18-ом и 19-ом веках. Вильям Вролик написал большой труд о мутациях, включающих циклопию, патогенез врожденных аномалий, и сиамских близнецов. Его персональная коллекция образцов, выстроенная на основе отцовской, насчитывала после его смерти несколько тысяч образцов.
Коллекция была выкуплена властями Амстердама в 1869 году, и, в конечном счете, нашла свое пристанище в университете. Другие анатомические коллекции добавлялись к музею на протяжении многих лет, включая необычные аномалии костей, зубов, и других органов. Так же в коллекции присутствуют образцы животных.
